科學(xué)家在實驗室重現(xiàn)生物進化過程
運行時間最長的進化試驗重現(xiàn)了自然界的另一面,并且展示了一種生物的重大變化如何改變它的環(huán)境以及居住在那個空間中所有生物的進化軌跡。
長期實驗進化項目開始于1988年。美國密歇根州立大學(xué)的Richard Lenski選擇了單菌株的大腸桿菌,并且創(chuàng)建了12種培養(yǎng)菌。
此后的每一天,每種培養(yǎng)菌的樣品都被轉(zhuǎn)移到以葡萄糖為主要營養(yǎng)物質(zhì)的新鮮培養(yǎng)基中。如今,自試驗開始,已有6萬多代大腸桿菌產(chǎn)生。
Lenski的試驗讓人們以前所未有的細節(jié)見證了進化。由于樣品每隔75天便被冷藏起來,因此研究團隊能再次辨認他們所看見的改變背后精確的基因突變。
最大的進化改變在約3.15萬代之后發(fā)生。在12種培養(yǎng)菌中,一種細胞系演化出以培養(yǎng)基中另一種化學(xué)物質(zhì)—檸檬酸為食的能力。如今,來自Lenski團隊的Caroline Turner和其他成員在一篇提交到預(yù)印本文獻庫的論文中描述了這種變化引發(fā)的一些影響。
大腸桿菌通常并不以檸檬酸為食,因為它們無法將其攜帶進細胞中。不過,食檸檬酸細菌中的一個突變使其產(chǎn)生逆向轉(zhuǎn)運蛋白CitT。該蛋白能讓檸檬酸繞過細胞膜進入細胞。這種蛋白的基因已經(jīng)存在,但在氧氣出現(xiàn)時通常會被關(guān)閉。
一旦以檸檬酸為食的能力進化出來,整個菌群便會繁盛,因為相同的培養(yǎng)基能維持更多細胞的生命。很快,這些以檸檬酸為食的細菌占據(jù)統(tǒng)治地位,戰(zhàn)勝了所有大腸桿菌,除了其中一株—該菌株反過來演化出利用被改變的環(huán)境的能力。
它通過產(chǎn)生更多的被稱為DctA的轉(zhuǎn)運蛋白成功做到了這一點。DctA能以很小的能量代價導(dǎo)入以檸檬酸為食的菌株所導(dǎo)出的琥珀酸和其他分子。不過,事情并未就此停止。檸檬酸吞食者隨后還開始制造更多的DctA,以試圖奪回在獲取檸檬酸過程中損失的一些琥珀酸和其他分子。